More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8366 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 310 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  65.38 
 
 		 288 aa  361  8e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  60.55 
 
 		 296 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  61.84 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  62.94 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  61.57 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  63.33 
 
 		 287 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  63.07 
 
 		 307 aa  328  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  58.95 
 
 		 303 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  58.53 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  59.57 
 
 		 299 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  58.33 
 
 		 299 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  56.83 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  55.83 
 
 		 290 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  54.55 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  51.84 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  54.45 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  52.26 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  56.32 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  55.4 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  55.33 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  52.11 
 
 		 288 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  52.11 
 
 		 288 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  53.38 
 
 		 347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  52.11 
 
 		 288 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  52.16 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  51.16 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  54.9 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  52.73 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  53.29 
 
 		 303 aa  262  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  52.43 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  56.18 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  55.48 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  49.29 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  55.12 
 
 		 581 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  54.98 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  42.27 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  46.32 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  42.23 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  42.34 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  37.63 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.69 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.92 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  37.41 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  43.14 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  42 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.05 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  44.23 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.93 
 
 		 383 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.04 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  39.34 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  39.23 
 
 		 362 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  38.74 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  37 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.23 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  42.51 
 
 		 366 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.46 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.54 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  39.57 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  38.91 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  37.55 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  41.99 
 
 		 615 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  41.23 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.91 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  38.03 
 
 		 353 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.23 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 357 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  38.93 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  42.73 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  37.93 
 
 		 382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.52 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  34.96 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 365 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  38.61 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.02 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.35 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 365 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  41.92 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  38.65 
 
 		 371 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  38.65 
 
 		 419 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.89 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.61 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>