More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0467 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 288 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  68.79 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  65.16 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  62.72 
 
 		 291 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  65.38 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  62.72 
 
 		 291 aa  341  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  63.51 
 
 		 287 aa  335  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  63.29 
 
 		 307 aa  328  9e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  64.06 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  57.6 
 
 		 293 aa  315  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  58.93 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  59.43 
 
 		 320 aa  303  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  58.06 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  57.6 
 
 		 311 aa  295  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  56.07 
 
 		 299 aa  295  7e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  57.34 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  61.57 
 
 		 285 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  58.12 
 
 		 315 aa  285  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  59.22 
 
 		 581 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  57.65 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  54.22 
 
 		 347 aa  279  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  54.58 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  54.58 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  54.58 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  63.1 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  52.45 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  51.9 
 
 		 300 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  53.9 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  53 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  53.05 
 
 		 311 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  54.06 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  53.17 
 
 		 313 aa  267  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  52.96 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  54.01 
 
 		 291 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  57.2 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  52.54 
 
 		 285 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  43.49 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  43.14 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  39.93 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  39.93 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.6 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.37 
 
 		 383 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  42.91 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.38 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  37.37 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  39.12 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  42.92 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  40.32 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  42.93 
 
 		 382 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  40.48 
 
 		 360 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  37.89 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  40.85 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.63 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.78 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.5 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  35.86 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  38.57 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  39.73 
 
 		 357 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  39.46 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  40.09 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  37.07 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  39.52 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.17 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.46 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.45 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  45.02 
 
 		 615 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  40.78 
 
 		 350 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  41.74 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  40.55 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  41.51 
 
 		 384 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 365 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  36.74 
 
 		 358 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  37.38 
 
 		 349 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.38 
 
 		 363 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.6 
 
 		 361 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  40.48 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  37.68 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  43.75 
 
 		 370 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.57 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  35.81 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  37.62 
 
 		 354 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.81 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  39.34 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  37.11 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  37.11 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.45 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.89 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  44.55 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  42.4 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>