More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0595 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 303 aa  597  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  64.29 
 
 		 290 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  63.1 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  63.1 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  63.1 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  62.84 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  62.2 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  60.69 
 
 		 293 aa  334  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  61.72 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  57.04 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  59.93 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  58.8 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  55.24 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  57.54 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  57.84 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  59.39 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  56.51 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  54.73 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  56.74 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  53.77 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  54.95 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  55.63 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  50.67 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  55.91 
 
 		 581 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  52.96 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  55.28 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  54.3 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  53.57 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  52.49 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  53.56 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  51.76 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  51.18 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  50.17 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  50.34 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  47.93 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  53.36 
 
 		 335 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  42.31 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  38.89 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  38.63 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  43.97 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.2 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  39.87 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  41.82 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  44.08 
 
 		 373 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  41.09 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  41.45 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  41.36 
 
 		 358 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  41.37 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  42.48 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  43.53 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  44.29 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  43.04 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  44.61 
 
 		 382 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  42.17 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  35.46 
 
 		 388 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  38.17 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  39.34 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  41.87 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.69 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  37.76 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  38.17 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  38.17 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  38.17 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  38.17 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  37.76 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  38.17 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  38.17 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.92 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  41.38 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  40.85 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  41.58 
 
 		 419 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  36.11 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  39.92 
 
 		 396 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  39.01 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  37.76 
 
 		 350 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  41.58 
 
 		 371 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  37.76 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  42.08 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  37.76 
 
 		 350 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  42.57 
 
 		 381 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.79 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  41.09 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  37.76 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.9 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  37.76 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  43.33 
 
 		 615 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.04 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  40.5 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.79 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  42.28 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  42.16 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  36.11 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  35.65 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  36.11 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  42 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  36.11 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>