More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4471 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  74.74 
 
 		 291 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  73.08 
 
 		 291 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  71.43 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  72.32 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  68.79 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  69.26 
 
 		 307 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  64.36 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  60.14 
 
 		 293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  61.84 
 
 		 310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  62.77 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  61.62 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  61.62 
 
 		 300 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  58.04 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  59.03 
 
 		 299 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  59.14 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  60.64 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  60.64 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  60.64 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  58.99 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  60.21 
 
 		 299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  58.87 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  58.3 
 
 		 290 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  61.99 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  57.76 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  57.54 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  55.13 
 
 		 347 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  59.03 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  53.38 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  58.3 
 
 		 291 aa  288  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  60.07 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  54.09 
 
 		 285 aa  281  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  58.39 
 
 		 581 aa  279  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  57.14 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  53.21 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  54.48 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  44.48 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  43.48 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  46.89 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  47.44 
 
 		 368 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  47.44 
 
 		 368 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  47.44 
 
 		 368 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  47.44 
 
 		 368 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  46.98 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  44.19 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  46.98 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  45.58 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  46.98 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.79 
 
 		 375 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.19 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.15 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  41.94 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.62 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  44.19 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  44.19 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  44.19 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  43.42 
 
 		 384 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  44.22 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  38.72 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.08 
 
 		 370 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.29 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  39.92 
 
 		 318 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  44.59 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.19 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.83 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  41.99 
 
 		 383 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  41.28 
 
 		 381 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  42.01 
 
 		 365 aa  159  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  42.15 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.45 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 		 349 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  41.63 
 
 		 373 aa  157  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.83 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  38.08 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.13 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  42.27 
 
 		 373 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.59 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  39.81 
 
 		 355 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  40 
 
 		 368 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  43 
 
 		 355 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.78 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  39.84 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  42.51 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  41.92 
 
 		 353 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 		 382 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  40.95 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  45.5 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  41.89 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  38.21 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.15 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 		 615 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.67 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  43.19 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  41.39 
 
 		 353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.35 
 
 		 355 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.86 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  39.15 
 
 		 349 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>