More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1171 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 331 aa  684    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  58.68 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  42.86 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  42.9 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  43.49 
 
 		 288 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  43.48 
 
 		 296 aa  245  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  39.39 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  40.47 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  45.23 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  42.67 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  39.67 
 
 		 291 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  41.51 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  43.36 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  42.26 
 
 		 581 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  40.8 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  42.05 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  42 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  41.64 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  42.52 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  39.46 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  39.4 
 
 		 304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  38.87 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  38.87 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  38.87 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  41.44 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  39.59 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  40.4 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  40.89 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  40.13 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  41.18 
 
 		 285 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  40.73 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  42.96 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  41.72 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  40.79 
 
 		 291 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  41.08 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  42.62 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  44.31 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  36.79 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  43.14 
 
 		 272 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  38.31 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  40.44 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  37.15 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  34.39 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  36.88 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  37.75 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  35 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  35 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  38.03 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.27 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  35 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  33.82 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  34.88 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  34.58 
 
 		 363 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  36.65 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  37.67 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  34.22 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  35.14 
 
 		 370 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  34.22 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  34.22 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  34.22 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  34.22 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  34.22 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  34.22 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  38.16 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  33.84 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  33.46 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.62 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.67 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.5 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  32.25 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.58 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.36 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  35 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  36.62 
 
 		 370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  34.02 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  36.62 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  36.62 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  36.62 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  34.02 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  36.36 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  35.04 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  35.45 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43811  predicted protein  35.86 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.91 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  37.02 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.84 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  35.98 
 
 		 366 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  33.61 
 
 		 371 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>