More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2917 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 317 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  76.97 
 
 		 318 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  60.26 
 
 		 308 aa  348  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  53.92 
 
 		 323 aa  328  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  47.28 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  42.05 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  40.51 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  43.05 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  38.99 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  44.53 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  41.23 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  40.88 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  41.85 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  40.85 
 
 		 365 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  49.76 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  41.12 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  41.04 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  44.95 
 
 		 388 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.34 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  44.5 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  43.23 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 365 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 365 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 365 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 365 aa  185  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  42.59 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.68 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  39.04 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  45.71 
 
 		 353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  40.46 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  43.12 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  41.32 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.57 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  45.13 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.24 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  45.23 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  45.45 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  44.12 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.57 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  41.45 
 
 		 355 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  43.84 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  43.04 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.3 
 
 		 363 aa  178  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  44.06 
 
 		 401 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  42.62 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.31 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  37.79 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.08 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  44.2 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  44.02 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  38.77 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  43.7 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  43.48 
 
 		 352 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  40.63 
 
 		 581 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  39.71 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  42.92 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.22 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  37.28 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 		 354 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  40.26 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 		 355 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  41.7 
 
 		 299 aa  175  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  41.01 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  43.33 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  43.43 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  41.15 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  42.11 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  43.03 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  38.37 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  45.05 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  39.41 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  44.61 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  45.83 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  39.29 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  40.26 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.86 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.55 
 
 		 368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.55 
 
 		 360 aa  172  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  44.8 
 
 		 396 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  35.34 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  46.99 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  40.89 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.08 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  44.08 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  42.98 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>