More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1393 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  75.09 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  72.36 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  60.93 
 
 		 281 aa  349  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  62.4 
 
 		 285 aa  341  7e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  58.78 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  65.58 
 
 		 222 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  42.08 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  39.39 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  40.46 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  39.3 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  49.19 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  45.83 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  42.98 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  40 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  38.74 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  35.54 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  37.04 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  36.92 
 
 		 297 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  38.37 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  34 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  34.26 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.62 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  35.56 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.36 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  40.51 
 
 		 323 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  34.56 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  35.53 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  40.74 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  41.54 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  36.23 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  34.28 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  38.18 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  34.86 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  39.78 
 
 		 388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.47 
 
 		 360 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  36.9 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  34.16 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  41.03 
 
 		 381 aa  138  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  40.64 
 
 		 353 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 383 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  42.78 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  39.35 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  40.41 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  34.8 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  40.98 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  40.11 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 381 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  36.79 
 
 		 435 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.21 
 
 		 368 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.11 
 
 		 375 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  38.97 
 
 		 382 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  41.12 
 
 		 381 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  33.7 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.84 
 
 		 374 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  37.25 
 
 		 388 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 		 434 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  37.63 
 
 		 374 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  33.93 
 
 		 299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.78 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  40.1 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.19 
 
 		 363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  40.61 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.09 
 
 		 367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  38.97 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  36.71 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  36.79 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  35.6 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  40.11 
 
 		 615 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.45 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  36.98 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.47 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.23 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  35.98 
 
 		 352 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  35.98 
 
 		 352 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  32.75 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  39.38 
 
 		 383 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  36.73 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.56 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  35.94 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  35.2 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  36.79 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  36.56 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  39.25 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  31.95 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>