More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12880 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  61.71 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  51.68 
 
 		 333 aa  303  1.0000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  51.96 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  45.74 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  44.65 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  46.51 
 
 		 299 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  41.79 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  44.28 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  42.35 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  42.08 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  45.74 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  40.71 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  37.2 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  35.94 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  36.15 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  37.6 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  39.35 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  34.21 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  40.2 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.93 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.07 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.07 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.07 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  43.79 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.76 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  42.51 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  42.08 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.24 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.2 
 
 		 375 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  32.97 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  40.49 
 
 		 369 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  43.79 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  41.71 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  44.12 
 
 		 362 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  41.5 
 
 		 368 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.27 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  39.41 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  42.39 
 
 		 382 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  46.21 
 
 		 407 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  39.77 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  38.82 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  39.41 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.7 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.7 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  42.37 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.7 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.7 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.7 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.7 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  39.18 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.7 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  40.98 
 
 		 381 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  37.65 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.26 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  44.38 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  38.01 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  43.86 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  31.87 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.4 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.41 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  40.23 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  34.25 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  46.03 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  33.03 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  40.86 
 
 		 357 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  36.26 
 
 		 365 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  36.26 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.01 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  40.12 
 
 		 356 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  36.99 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  35.67 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  31.43 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.26 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  39.88 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 352 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 381 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  48.41 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  31.8 
 
 		 354 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  35.67 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  35.67 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  38.46 
 
 		 354 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  36.42 
 
 		 358 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  35.67 
 
 		 363 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  42.08 
 
 		 381 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.26 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  42.08 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  41.86 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  37.71 
 
 		 396 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  45.45 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  35.09 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  45.26 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 359 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  36.42 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>