More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3218 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  100 
 
 
288 aa  589  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  51.52 
 
 
297 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  49.28 
 
 
292 aa  270  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  49.43 
 
 
294 aa  266  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  46.74 
 
 
298 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  43.89 
 
 
285 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  45 
 
 
285 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  52.09 
 
 
315 aa  236  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  43.35 
 
 
299 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  42.54 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  42.64 
 
 
315 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  40.71 
 
 
284 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  37.87 
 
 
333 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  41.35 
 
 
278 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  41.18 
 
 
298 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  40 
 
 
278 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  41.26 
 
 
281 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  38.58 
 
 
278 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  38.89 
 
 
285 aa  155  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  41.15 
 
 
222 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  32.78 
 
 
318 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  32.45 
 
 
317 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  34.53 
 
 
272 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  46.1 
 
 
353 aa  135  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  33 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
352 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  36.14 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  34.77 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  46.72 
 
 
435 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  35.54 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  31.93 
 
 
581 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  32.85 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  29.79 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  30.74 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  34.44 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  30.95 
 
 
311 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  33.1 
 
 
288 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  43.57 
 
 
381 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  37.84 
 
 
351 aa  125  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  33.47 
 
 
330 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 
348 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  34.95 
 
 
355 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  42.76 
 
 
355 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  41.56 
 
 
324 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  44.22 
 
 
355 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  31.32 
 
 
303 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  33.09 
 
 
290 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  33.22 
 
 
313 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  42.45 
 
 
434 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  34.34 
 
 
288 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 
350 aa  122  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  34.34 
 
 
288 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  34.34 
 
 
288 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.45 
 
 
368 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  34.58 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  32.98 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  31.62 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  32.41 
 
 
363 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  42.18 
 
 
381 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  31.01 
 
 
309 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.16 
 
 
352 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.3 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.16 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  30.1 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  31.94 
 
 
291 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  33.22 
 
 
296 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  45.93 
 
 
382 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0010  A/G-specific adenine glycosylase  38.67 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  45.93 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  32.47 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.87 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  33.45 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  34 
 
 
339 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  46.88 
 
 
356 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  34 
 
 
339 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  37.91 
 
 
354 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  35.94 
 
 
386 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  44.44 
 
 
362 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  34 
 
 
339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.72 
 
 
361 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  37.91 
 
 
354 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  34.21 
 
 
382 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.37 
 
 
359 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  30.42 
 
 
303 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.28 
 
 
368 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.28 
 
 
368 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.75 
 
 
370 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.28 
 
 
368 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.72 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  36.13 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  30.95 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>