More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2875 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  100 
 
 		 291 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  74.23 
 
 		 291 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  73.08 
 
 		 296 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  71.13 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  70.21 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  68.09 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  65.16 
 
 		 288 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  63.57 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  61.84 
 
 		 310 aa  338  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  61.25 
 
 		 320 aa  332  6e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  59.04 
 
 		 293 aa  326  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  60.9 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  58.06 
 
 		 300 aa  315  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  61.94 
 
 		 299 aa  315  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  58.42 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  59.43 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  59.43 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  59.43 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  57.04 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  60.95 
 
 		 315 aa  301  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  59.29 
 
 		 311 aa  301  9e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  56.84 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  54.01 
 
 		 300 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  59.57 
 
 		 300 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  56.4 
 
 		 347 aa  291  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  55.32 
 
 		 290 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  56.62 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  58.19 
 
 		 303 aa  288  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  54.64 
 
 		 313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  59.01 
 
 		 581 aa  281  9e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  54.26 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  57.65 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  56.89 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  58.66 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  53.6 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  56.58 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  45.51 
 
 		 328 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  42.35 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  48.34 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.8 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  43.14 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  41.11 
 
 		 323 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  47.03 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  41.75 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  40.64 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  37.87 
 
 		 373 aa  161  9e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  40.57 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  36.76 
 
 		 388 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  40.1 
 
 		 358 aa  158  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  34.75 
 
 		 349 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  39.64 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.89 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  36.82 
 
 		 373 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.9 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  44.06 
 
 		 363 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.09 
 
 		 360 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  39.13 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 355 aa  155  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  41.53 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.25 
 
 		 359 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  39.17 
 
 		 368 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  40.65 
 
 		 353 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  39.16 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  39.51 
 
 		 344 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  39.25 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.66 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 382 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.61 
 
 		 360 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  40.09 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  40.09 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  40.09 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  40.09 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  40.09 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  45.97 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  40.76 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  40.09 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  41.31 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.72 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.19 
 
 		 375 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  41.92 
 
 		 407 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  39.62 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.09 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.62 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  40.8 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  42.18 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  38.91 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  39.23 
 
 		 357 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.17 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  39.15 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>