More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5132 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  100 
 
 
288 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  100 
 
 
288 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  100 
 
 
288 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  79.79 
 
 
290 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  79.17 
 
 
291 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  72.92 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  65.86 
 
 
300 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  65.64 
 
 
293 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  63.1 
 
 
303 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  64.36 
 
 
329 aa  348  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  65.34 
 
 
300 aa  318  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  60.64 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  58.45 
 
 
291 aa  308  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  59.43 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  60.64 
 
 
299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  58.51 
 
 
291 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  59.22 
 
 
299 aa  300  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  58.21 
 
 
287 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  59.79 
 
 
320 aa  291  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  57.8 
 
 
303 aa  285  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  56.12 
 
 
300 aa  281  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  56.94 
 
 
307 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  54.58 
 
 
288 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  54.04 
 
 
311 aa  270  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  51.41 
 
 
310 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  55.99 
 
 
285 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  54.65 
 
 
311 aa  255  8e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  54.84 
 
 
313 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  54.12 
 
 
303 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  53.28 
 
 
315 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  53.24 
 
 
581 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  53.9 
 
 
335 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  50 
 
 
285 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  47.59 
 
 
313 aa  221  9e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  45.51 
 
 
308 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  38.87 
 
 
331 aa  215  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  45.24 
 
 
347 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  39.61 
 
 
328 aa  199  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  45.49 
 
 
272 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  37.63 
 
 
323 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  43.21 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  43.27 
 
 
358 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.93 
 
 
383 aa  158  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  42.79 
 
 
358 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  41.25 
 
 
309 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 
349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  44.71 
 
 
615 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 
360 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  43.27 
 
 
388 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  40.42 
 
 
357 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.87 
 
 
361 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.98 
 
 
367 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  43.2 
 
 
355 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  42.15 
 
 
376 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.17 
 
 
374 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  41.83 
 
 
308 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  40.57 
 
 
318 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.18 
 
 
345 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  45.37 
 
 
382 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  40.71 
 
 
359 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  42.72 
 
 
383 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.37 
 
 
348 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  42.72 
 
 
355 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.8 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  39.74 
 
 
401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  37.27 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
344 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  43.88 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.72 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  43.2 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  39.5 
 
 
367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 
388 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  43.33 
 
 
405 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.29 
 
 
351 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1337  HhH-GPD family protein  38.95 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  40.44 
 
 
344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  37.76 
 
 
365 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  39.59 
 
 
355 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 
373 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.5 
 
 
350 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  42.72 
 
 
382 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  36.71 
 
 
339 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 
368 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
365 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  43 
 
 
464 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  42.05 
 
 
341 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 
370 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
365 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43811  predicted protein  39.63 
 
 
245 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  41.63 
 
 
371 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
355 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  38.22 
 
 
384 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>