More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1337 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1337  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  39.93 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  38.95 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  38.95 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  38.95 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  39.3 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  39.64 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  40.3 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  41.22 
 
 		 581 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  38.18 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  37.92 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  39.78 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  38.71 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  36.15 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  36.24 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  39.13 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  39.93 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  39.7 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  33.98 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  37.64 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  38.24 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  40.78 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  40.08 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  34.31 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.7 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  36.39 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  35.31 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  37.73 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  35.74 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  37.66 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  36.5 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  37.66 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  35.14 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  36.09 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.71 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  36.97 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  36.36 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  34.22 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  34.87 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  39.08 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  39.18 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  37.78 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  37.64 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  35.5 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  39.2 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  38.16 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  38.14 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  33.58 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  38.66 
 
 		 355 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  35.14 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  37.31 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  36.73 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  32.57 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  38.78 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  38.35 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  35.26 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  39.37 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  32.27 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  32.57 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  36.73 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.47 
 
 		 368 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  32.11 
 
 		 365 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  31.54 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.63 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  36.99 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  35.2 
 
 		 396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  36.6 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  32.31 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  35.42 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0019  A/G-specific adenine glycosylase  41.92 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  37.59 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  37.44 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.22 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.81 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  35.41 
 
 		 353 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  36.79 
 
 		 371 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  35.26 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  36.22 
 
 		 354 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  30.71 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  37.56 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  39.8 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  35.68 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  38.17 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.65 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  36.79 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  36.79 
 
 		 419 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  38.65 
 
 		 347 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  36.73 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  35.11 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>