More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0019 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0019  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 343 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  50.15 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  48.56 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  45.54 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.81 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  43.09 
 
 		 358 aa  222  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  42.21 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  45.54 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  45.91 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  42.67 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.19 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.28 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  47 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  45.6 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  40.8 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.62 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  45.1 
 
 		 464 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  40.88 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  49.62 
 
 		 367 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  44.72 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.9 
 
 		 349 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.51 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.95 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  37.18 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  35.45 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  37.18 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  42.19 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  37.85 
 
 		 400 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  42.33 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.38 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.77 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  39.17 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.28 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.61 
 
 		 350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  41.05 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  44.37 
 
 		 357 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  36.88 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 350 aa  199  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  34.71 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  42.26 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  41.5 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  46.67 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.06 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  35.39 
 
 		 347 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  41.06 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  35.26 
 
 		 373 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  38.76 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.76 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  38.04 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.32 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  46.33 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  40.88 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  36.3 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  40.88 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  38.11 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  37.8 
 
 		 355 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  37.93 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  39.29 
 
 		 352 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  39.26 
 
 		 354 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  40.88 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  39.19 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  41.18 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  35.42 
 
 		 364 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  43 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.29 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  45.85 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  44.85 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.07 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  43.16 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.86 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  38.19 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  39.59 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  35.58 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 		 368 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 		 368 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  37 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  38.82 
 
 		 419 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  38.41 
 
 		 371 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  37.42 
 
 		 354 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.21 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.53 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  42.16 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  35.74 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  37.66 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  42.77 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  35.31 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.04 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  40.65 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  37.75 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  43.3 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  35.31 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>