More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9146 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  100 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  77.82 
 
 		 287 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  75.35 
 
 		 291 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  71.43 
 
 		 296 aa  407  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  68.09 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  67.72 
 
 		 307 aa  352  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  62.72 
 
 		 288 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  62.94 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  57.8 
 
 		 299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  59.38 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  58.51 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  61.48 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  58.51 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  58.51 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  56.64 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  56.29 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  56.38 
 
 		 299 aa  298  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  56.64 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  59.03 
 
 		 320 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  57.74 
 
 		 308 aa  295  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  53.82 
 
 		 300 aa  292  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  55.48 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  53.38 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  56.75 
 
 		 300 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  54.11 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  54.73 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  55.17 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  54.27 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  55.93 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  54.1 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  53.2 
 
 		 313 aa  271  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  55.79 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  55.86 
 
 		 581 aa  265  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  52.14 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  54.39 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  56.89 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  45.25 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.47 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  42.8 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  38.78 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  45.77 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  39.02 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.22 
 
 		 388 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  43.48 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.77 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  41.44 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.15 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  41.28 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  45.85 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.51 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.05 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.6 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.13 
 
 		 370 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  43.13 
 
 		 368 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  44.5 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 369 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  45.97 
 
 		 359 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.91 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.13 
 
 		 368 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  43.72 
 
 		 615 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.09 
 
 		 372 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.48 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.18 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.17 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  41.1 
 
 		 373 aa  152  5e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  30.2 
 
 		 347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.18 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  40.3 
 
 		 349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  38.39 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  38.35 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 362 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  43.04 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  42.93 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.73 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  42.92 
 
 		 376 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  42.93 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.42 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.08 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  42.93 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.17 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.5 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  38.33 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  36.73 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.63 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  40.71 
 
 		 401 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  40.37 
 
 		 384 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>