More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2555 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 315 aa  650    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  74.19 
 
 		 365 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  64.65 
 
 		 314 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  59.38 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  53.44 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  50.46 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  45.85 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  46.3 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  51.38 
 
 		 350 aa  298  6e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  50.89 
 
 		 366 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  44.05 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.51 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  41.04 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  39.04 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  38.51 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  38.87 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  39.68 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  36.66 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  37.41 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.33 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  34.85 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  36.81 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.26 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  33.23 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  34.95 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  33.24 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  42.92 
 
 		 461 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.91 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  33 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  34.8 
 
 		 462 aa  165  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.11 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  29.84 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.07 
 
 		 390 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.76 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  29.45 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.49 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.59 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.59 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.59 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.8 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  35.71 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  29.3 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.4 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  31.92 
 
 		 553 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  26.56 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  31.94 
 
 		 256 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.41 
 
 		 532 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.51 
 
 		 544 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  31.15 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  31.49 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.82 
 
 		 600 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.65 
 
 		 542 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  31.39 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  31.39 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  31.39 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  31.39 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  31.39 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  30.77 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.17 
 
 		 517 aa  106  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  29.2 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  31.48 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 		 536 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  30.94 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.3 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  31.67 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  27.72 
 
 		 628 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.11 
 
 		 531 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  29.48 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  32.03 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  30.74 
 
 		 542 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  28.77 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.18 
 
 		 584 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.84 
 
 		 530 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.17 
 
 		 595 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.43 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  32.09 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.84 
 
 		 530 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.13 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.84 
 
 		 528 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.86 
 
 		 526 aa  99.8  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  29.84 
 
 		 536 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  30.09 
 
 		 536 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  29.41 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  26.56 
 
 		 261 aa  99.4  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  31.34 
 
 		 548 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  35.07 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  29.57 
 
 		 531 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  28.1 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  28.57 
 
 		 269 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  32.79 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  29.17 
 
 		 537 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  31.12 
 
 		 254 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  27.53 
 
 		 300 aa  95.9  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  29.26 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  27.08 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.1 
 
 		 541 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0504  preprotein translocase subunit  37.4 
 
 		 198 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  31.58 
 
 		 530 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  27.64 
 
 		 556 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  29.5 
 
 		 609 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>