More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0221 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  46.34 
 
 
251 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.53 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  44.96 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.36 
 
 
291 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
255 aa  178  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  38.29 
 
 
289 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  42.25 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
307 aa  168  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  38.64 
 
 
293 aa  168  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  37.61 
 
 
296 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1705  ABC transporter related  39.51 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  33.04 
 
 
295 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  41.12 
 
 
325 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.87 
 
 
251 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
308 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  38.82 
 
 
246 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0134  ABC transporter related  38.21 
 
 
255 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  40.55 
 
 
290 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
288 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  34.96 
 
 
301 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
369 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  39.64 
 
 
315 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
289 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  37.84 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
292 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
315 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  38.84 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  38.64 
 
 
284 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
282 aa  151  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  37.1 
 
 
317 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  33.46 
 
 
294 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  32.73 
 
 
295 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.61 
 
 
236 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  36.84 
 
 
292 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 
293 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 
244 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  36.84 
 
 
292 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  36.84 
 
 
292 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  37.27 
 
 
292 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.09 
 
 
305 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  37.44 
 
 
303 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  37.9 
 
 
319 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  37.9 
 
 
311 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  39.09 
 
 
292 aa  148  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  36.04 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  38.81 
 
 
331 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  37.44 
 
 
328 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  39.01 
 
 
329 aa  146  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  38.36 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
317 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  36.84 
 
 
299 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  32.41 
 
 
290 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 
316 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.32 
 
 
330 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  37.44 
 
 
308 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  33.48 
 
 
240 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  33.2 
 
 
298 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.6 
 
 
282 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  35.29 
 
 
360 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  36.53 
 
 
320 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  36.53 
 
 
320 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  33.79 
 
 
317 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 
303 aa  141  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.71 
 
 
305 aa  141  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  35.43 
 
 
303 aa  141  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
286 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.91 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.39 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  36.27 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.5 
 
 
301 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  37.74 
 
 
300 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  36 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  38.6 
 
 
344 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  34.85 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  35.81 
 
 
339 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.78 
 
 
308 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  37.1 
 
 
235 aa  138  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  39.73 
 
 
300 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
312 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.44 
 
 
307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
589 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
336 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 
307 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  36.48 
 
 
327 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  39.25 
 
 
325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  35.98 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.14 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 
312 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  35.74 
 
 
315 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  39.46 
 
 
299 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  32.77 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  30.61 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>