More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0876 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0876  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 559 aa  1138    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1045  extracellular solute-binding protein family 5  47.5 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3203  extracellular solute-binding protein family 5  45.33 
 
 		 641 aa  487  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3201  extracellular solute-binding protein family 5  43.3 
 
 		 638 aa  463  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  39 
 
 		 588 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0133  extracellular solute-binding protein family 5  36.26 
 
 		 664 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0005  extracellular solute-binding protein family 5  34.27 
 
 		 599 aa  274  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 567 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  23.77 
 
 		 541 aa  123  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  23.64 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 583 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1438  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.3177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 584 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 547 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 578 aa  97.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  28.52 
 
 		 381 aa  97.4  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 		 516 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 534 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 530 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 565 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 572 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 607 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 		 533 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 568 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.47 
 
 		 531 aa  94  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 611 aa  93.6  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 557 aa  93.6  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 576 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 587 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 555 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 636 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.14 
 
 		 588 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 		 573 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 567 aa  92  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 559 aa  90.9  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 607 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 		 596 aa  90.5  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 611 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 560 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 557 aa  90.1  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 611 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3996  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 540 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 611 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.76 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 532 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 509 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 516 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 534 aa  87.8  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 539 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  26.59 
 
 		 572 aa  87  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  29.43 
 
 		 611 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 615 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.65 
 
 		 593 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 526 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.65 
 
 		 593 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 607 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.65 
 
 		 593 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 536 aa  86.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 613 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.65 
 
 		 593 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.35 
 
 		 593 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  29.73 
 
 		 615 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 545 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  25 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.65 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4214  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.08 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.35 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 544 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 606 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  21.11 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  21.11 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 594 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  25.52 
 
 		 602 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  29.39 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4660  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.845725  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  29.01 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.43 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  28.12 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>