More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0552 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  41.47 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  42.51 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  38.55 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  40.78 
 
 		 286 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  33.2 
 
 		 825 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 862 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.38 
 
 		 806 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 		 874 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  34.67 
 
 		 891 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 840 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 867 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 785 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 849 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  34.94 
 
 		 847 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 847 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 859 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 843 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  34.83 
 
 		 809 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 		 844 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 860 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 685 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  30.31 
 
 		 825 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 830 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 435 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 832 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  30.2 
 
 		 803 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 796 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 414 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 795 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 636 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 636 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 864 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  31.35 
 
 		 813 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  28.98 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  25.91 
 
 		 753 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 883 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 866 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  30.77 
 
 		 806 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 567 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 910 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 406 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  31.06 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 435 aa  99.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 452 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 794 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 359 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  30.77 
 
 		 807 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 400 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 909 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 845 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.69 
 
 		 773 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 451 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  34.64 
 
 		 1166 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 879 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 947 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.58 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 444 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 814 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  27.64 
 
 		 563 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 401 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 813 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 360 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 401 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 815 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 752 aa  97.4  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 853 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 909 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  27.9 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 352 aa  96.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  30.68 
 
 		 450 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 817 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 544 aa  96.3  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 458 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  28.05 
 
 		 532 aa  95.9  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  34.64 
 
 		 1111 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 868 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 429 aa  95.9  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.68 
 
 		 450 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.68 
 
 		 450 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  30.68 
 
 		 450 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.68 
 
 		 450 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>