More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10890 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  727    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.86 
 
 		 349 aa  486  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.2 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.14 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.81 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.81 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.87 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.52 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.53 
 
 		 374 aa  352  5e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.49 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.06 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.49 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.86 
 
 		 343 aa  333  4e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  49.15 
 
 		 356 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.36 
 
 		 375 aa  332  5e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.65 
 
 		 375 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.51 
 
 		 371 aa  329  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.76 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.7 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.63 
 
 		 348 aa  326  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 		 348 aa  325  9e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.72 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.78 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.72 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.96 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  50 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.47 
 
 		 347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.25 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.43 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.85 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.07 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.41 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.89 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.73 
 
 		 350 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.14 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.16 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  45.69 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  43.55 
 
 		 352 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.42 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.42 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.42 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  44.19 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.98 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0765  tartrate dehydrogenase  49 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  43.63 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  43.35 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.43 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  44.44 
 
 		 363 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4849  tartrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  43.52 
 
 		 358 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0462  tartrate dehydrogenase  44.63 
 
 		 357 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00797383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  43.3 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  43.87 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.57 
 
 		 351 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.32 
 
 		 342 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.71 
 
 		 336 aa  289  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  43.75 
 
 		 375 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  43.59 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  43.59 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2776  tartrate dehydrogenase  44 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  42.9 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  43.75 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1512  tartrate dehydrogenase  43.42 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1756  tartrate dehydrogenase  43.42 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147675 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  44.1 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1616  tartrate dehydrogenase  43.42 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.409343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.55 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2612  tartrate dehydrogenase  42 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0777  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  42.7 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.7 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  42.7 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.7 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  43.59 
 
 		 362 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.92 
 
 		 345 aa  285  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  42.7 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  42.7 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3895  tartrate dehydrogenase  42.77 
 
 		 355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  43.02 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  43.18 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.42 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  42.33 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.7 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1612  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.85 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0828  tartrate dehydrogenase  42.12 
 
 		 352 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  42.42 
 
 		 361 aa  282  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  43.14 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.62 
 
 		 342 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  43.66 
 
 		 360 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2573  tartrate dehydrogenase  41.71 
 
 		 350 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2618  tartrate dehydrogenase  41.71 
 
 		 350 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4999  tartrate dehydrogenase  43.43 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  43.06 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0647  tartrate dehydrogenase  41.95 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  42.94 
 
 		 362 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  43.3 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0534  tartrate dehydrogenase  42.61 
 
 		 358 aa  279  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.23 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  44.16 
 
 		 359 aa  278  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>