More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0791 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 373 aa  750    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.99 
 
 		 346 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  30.57 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  30.84 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.77 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  32.78 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  26.98 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.73 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  28.8 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  29.35 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.14 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  28.38 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.56 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  25.9 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  27.11 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 380 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  25.96 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  26.85 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 		 456 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  24.93 
 
 		 401 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  25.15 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  25.14 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  32.24 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 		 410 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  26.05 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 359 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  29.1 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  25.61 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  32.09 
 
 		 581 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  31.15 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  24.57 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  28.01 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  29.36 
 
 		 571 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  26.58 
 
 		 416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.11 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  26.92 
 
 		 371 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 504 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.61 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 		 400 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  28.34 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.91 
 
 		 580 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.24 
 
 		 512 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  26.93 
 
 		 517 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.31 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.25 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  27.1 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  25.9 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 497 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 537 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26.18 
 
 		 370 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  27.9 
 
 		 577 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  27.19 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 		 587 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 538 aa  106  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 		 640 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  23.35 
 
 		 400 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 683 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  28.22 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.12 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  28.66 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  25.62 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 483 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  25.41 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.08 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>