255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3232 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 372 aa  754    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  67.92 
 
 		 384 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  67.65 
 
 		 384 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  61.73 
 
 		 380 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  59.14 
 
 		 383 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  61.19 
 
 		 380 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  59.41 
 
 		 379 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  52.56 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  51.23 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  48.36 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  48.36 
 
 		 376 aa  359  3e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 388 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  44.72 
 
 		 384 aa  332  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  44.17 
 
 		 384 aa  325  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  40.8 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  43.49 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  41.1 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  41.55 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 383 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  39.25 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  40.98 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  38.48 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  36.78 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  38.75 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  36.51 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 385 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  38.17 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  38.69 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  36.19 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.02 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  37.8 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  37.8 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  35.64 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  37.03 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  34.85 
 
 		 383 aa  240  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  38.37 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  38.25 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.85 
 
 		 384 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  38.55 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 		 376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  36.31 
 
 		 383 aa  236  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  36.44 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  38.08 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  34.53 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.95 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  37.31 
 
 		 375 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  37.64 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  36.19 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 390 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  37.31 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  37 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  35.31 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  35.24 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  37.01 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  35.53 
 
 		 377 aa  228  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 		 379 aa  228  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  36.01 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.01 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  39.87 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  36.63 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  35.03 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  36.61 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  36.5 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 		 379 aa  225  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  36.16 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 382 aa  222  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  34.15 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 380 aa  222  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  35.04 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  36.28 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.43 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  38.18 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  37.32 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  33.06 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  34.7 
 
 		 410 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  32.78 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  36.24 
 
 		 376 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  32.78 
 
 		 382 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  32.78 
 
 		 382 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>