More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2806 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  74.31 
 
 		 218 aa  338  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  75.6 
 
 		 209 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  71.36 
 
 		 220 aa  323  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  71.36 
 
 		 220 aa  321  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  61.93 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.42 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.81 
 
 		 227 aa  251  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.93 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.79 
 
 		 219 aa  247  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.42 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.68 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.37 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.33 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.22 
 
 		 356 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  46.83 
 
 		 356 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.28 
 
 		 356 aa  195  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.21 
 
 		 356 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  50 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  50 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 357 aa  190  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  48.13 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  50.28 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.15 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  44.21 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.85 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  44.69 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.26 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  39.78 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.62 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  37.1 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  37.5 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  36.67 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  35.96 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  37.1 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  37.29 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  39.89 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  35.71 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  35.52 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  35.24 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  36.67 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  34.64 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  35.91 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  37.11 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  38.38 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.72 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  37.5 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  36.93 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  35.11 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  36.57 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  35.8 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  33.82 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  37.57 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  34.25 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  34.86 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  36.02 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  32.2 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  36.96 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  36.51 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  34.78 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  35.11 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  35.11 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  35.11 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  35.11 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  37.14 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.14 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  35.11 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  35.11 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.36 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  38.12 
 
 		 222 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  39.08 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  38.07 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  37.5 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  35.23 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  35.8 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  35.03 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  34.86 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  33.33 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.26 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  33.33 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.7 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  36.36 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  34.95 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  35 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.27 
 
 		 178 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  35.75 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  37.16 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  35.23 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  35.75 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  35.8 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  34.85 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  34.27 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  32.73 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  35.23 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  35.71 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  34.44 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  34.59 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  35.59 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  34.57 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.03 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>