161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1894 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  47.53 
 
 		 318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  24.92 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  29.28 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  24.28 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  24.3 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  25.57 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  23.1 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  25.28 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  27.97 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  20.95 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  23.03 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  23.3 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  26.57 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  26.36 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  23.23 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  24.61 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  20.48 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  24.06 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  26.36 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  29.21 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.5 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  28 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  22.4 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  22.76 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  23.59 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  23.79 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  25.97 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  24.91 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  25.2 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  28.35 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  22.18 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  25.18 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  21.95 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  26.17 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  32.79 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  25.98 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  23.26 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  31.16 
 
 		 154 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.55 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  21.98 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  24.8 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  22.98 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  22.59 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  22.18 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  24.29 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  29.53 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  24.58 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  24.51 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  23.27 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  30.6 
 
 		 186 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  25.36 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  21.47 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  19.12 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 184 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  19.12 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  23.11 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  22.06 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  22.4 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.83 
 
 		 515 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  24.11 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  27.64 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  27.14 
 
 		 188 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  28.89 
 
 		 178 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.95 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  20.97 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  27.97 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  26.43 
 
 		 188 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  37.97 
 
 		 178 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  29.32 
 
 		 187 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  23.66 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.95 
 
 		 184 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.95 
 
 		 188 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  23.79 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.95 
 
 		 186 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.95 
 
 		 186 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  34.95 
 
 		 189 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  34.95 
 
 		 186 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  20.94 
 
 		 529 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.95 
 
 		 186 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  18.47 
 
 		 321 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  22.22 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  21.03 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  18.95 
 
 		 579 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03730  virulence factor Mce family protein  22.22 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  24.63 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  30.15 
 
 		 181 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  21.53 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  24.74 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4999  virulence factor Mce family protein  23.51 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  21.58 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  29.1 
 
 		 184 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  33.05 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  23.63 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  20.12 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2822  virulence factor Mce family protein  25.25 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.883459  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  33.05 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>