211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0533 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  66.17 
 
 		 510 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 762 aa  1556    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  38.06 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  36.21 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  35.8 
 
 		 514 aa  293  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  33.99 
 
 		 495 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  35.63 
 
 		 499 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  35.66 
 
 		 491 aa  282  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  33.13 
 
 		 495 aa  280  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  28.26 
 
 		 508 aa  170  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1984  sporulation-related protein  50.98 
 
 		 370 aa  151  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.799506  normal  0.473474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1932  hypothetical protein  47.87 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1354  Sporulation domain protein  42.86 
 
 		 409 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89794e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2860  Sporulation domain protein  42.86 
 
 		 235 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00718845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  25.1 
 
 		 587 aa  108  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2814  sporulation domain-containing protein  39.87 
 
 		 369 aa  107  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 486 aa  101  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 528 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0657  sporulation domain-containing protein  34.84 
 
 		 339 aa  98.6  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  25.21 
 
 		 522 aa  95.1  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 559 aa  92  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1320  Sporulation domain protein  36.42 
 
 		 333 aa  91.3  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2317  Sporulation domain protein  37.88 
 
 		 375 aa  90.9  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0023097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  22.98 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  25.16 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1906  Sporulation domain protein  34.44 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  24.48 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 506 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  25.22 
 
 		 517 aa  72  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 647 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 537 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 690 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.99 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.85 
 
 		 452 aa  67  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  21.81 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.87 
 
 		 518 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.64 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.54 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  27.55 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.92 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.68 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.7 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.35 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.78 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.43 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  26.04 
 
 		 501 aa  62  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.12 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.14 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2232  outer membrane efflux family protein  22.93 
 
 		 475 aa  60.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.63 
 
 		 490 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.23 
 
 		 489 aa  60.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3484  Outer membrane protein-like protein  22.4 
 
 		 1139 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.63 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.91 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.98 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.94 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1562  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.48 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.08 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  24.05 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  23.96 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  21.55 
 
 		 542 aa  57.4  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  21.55 
 
 		 542 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 458 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.79 
 
 		 463 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4409  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.05 
 
 		 478 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.19 
 
 		 441 aa  56.6  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.41 
 
 		 600 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 738 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 463 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  25.23 
 
 		 469 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.12 
 
 		 463 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.57 
 
 		 472 aa  55.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.81 
 
 		 425 aa  55.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.15 
 
 		 472 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.58 
 
 		 497 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 462 aa  55.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.2 
 
 		 496 aa  55.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.2 
 
 		 496 aa  55.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.58 
 
 		 488 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.87 
 
 		 531 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.9 
 
 		 444 aa  54.7  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 419 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  28.18 
 
 		 476 aa  54.3  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  28.18 
 
 		 476 aa  54.3  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.1 
 
 		 442 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  25.33 
 
 		 438 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  25.65 
 
 		 606 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.32 
 
 		 476 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.32 
 
 		 476 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>