More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1653 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  100 
 
 		 610 aa  1190    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  59.89 
 
 		 563 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.36 
 
 		 594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.36 
 
 		 594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.36 
 
 		 594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.36 
 
 		 594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 589 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  36.68 
 
 		 589 aa  313  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.01 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.01 
 
 		 594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.01 
 
 		 594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  35.01 
 
 		 594 aa  309  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  34.65 
 
 		 594 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  34.68 
 
 		 598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.97 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  34.48 
 
 		 594 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  35.85 
 
 		 630 aa  301  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  34.82 
 
 		 594 aa  299  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34.88 
 
 		 951 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  34.26 
 
 		 594 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  34.13 
 
 		 594 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  34.13 
 
 		 594 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  37.66 
 
 		 631 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  34 
 
 		 599 aa  296  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  33.96 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  35.97 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  33.96 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.96 
 
 		 594 aa  294  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  35.63 
 
 		 589 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  36.07 
 
 		 589 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 		 608 aa  289  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  38.89 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  36.49 
 
 		 590 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  36.23 
 
 		 589 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  34.43 
 
 		 663 aa  287  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  35.04 
 
 		 597 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  34.77 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  38.13 
 
 		 606 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  35.48 
 
 		 595 aa  284  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  36.61 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  33.8 
 
 		 593 aa  282  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  37.73 
 
 		 593 aa  281  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.7 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  37.39 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  35.47 
 
 		 954 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  37.84 
 
 		 593 aa  277  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  35.87 
 
 		 604 aa  276  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  33.16 
 
 		 617 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  33.74 
 
 		 950 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  33.91 
 
 		 608 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  32.23 
 
 		 648 aa  272  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  33.91 
 
 		 608 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  33.61 
 
 		 604 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  34.86 
 
 		 583 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  38.75 
 
 		 608 aa  270  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  32.47 
 
 		 643 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  37.14 
 
 		 823 aa  266  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  36.04 
 
 		 603 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 652 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  36.81 
 
 		 582 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  36.91 
 
 		 823 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.35 
 
 		 827 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  34.02 
 
 		 613 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.94 
 
 		 647 aa  263  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  35.16 
 
 		 652 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  36.15 
 
 		 611 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.7 
 
 		 597 aa  261  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  34.88 
 
 		 682 aa  260  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  31.97 
 
 		 646 aa  260  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  34.4 
 
 		 616 aa  259  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  35.23 
 
 		 612 aa  259  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  37.59 
 
 		 586 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  35.8 
 
 		 634 aa  256  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  34.15 
 
 		 590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.43 
 
 		 646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.79 
 
 		 596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  33.63 
 
 		 625 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  30.78 
 
 		 643 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  34.63 
 
 		 678 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  34.35 
 
 		 652 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  35.22 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.16 
 
 		 830 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  34.78 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  50.39 
 
 		 255 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  32.87 
 
 		 608 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  33.93 
 
 		 603 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.65 
 
 		 333 aa  246  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  33.8 
 
 		 590 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  49 
 
 		 257 aa  246  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  48.61 
 
 		 255 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  49.8 
 
 		 258 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  49.8 
 
 		 258 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  49.8 
 
 		 258 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  50.57 
 
 		 275 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  50.57 
 
 		 275 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  50.6 
 
 		 261 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  32.42 
 
 		 629 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  50.57 
 
 		 275 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>