231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3446 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  40.44 
 
 		 180 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  33.93 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  32.56 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.15 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  31.55 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.06 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30.36 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  31.14 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  29.09 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  32.77 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.25 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  34.5 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  34.5 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.7 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  29.38 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  30.54 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  30.53 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  29.71 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.04 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.94 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.02 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.09 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  29.48 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.37 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  30 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.09 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.81 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.81 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.57 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  30.08 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.89 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.35 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  31.75 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.98 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30.95 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25.15 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  28.72 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.18 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.8 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  26.34 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.49 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.38 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  26.63 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.18 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.37 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  23.9 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.78 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.37 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1059  nitroreductase  25.15 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000184024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  29.52 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  24.23 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.25 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.3 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  31.78 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  27.86 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  24.58 
 
 		 275 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  29.53 
 
 		 348 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  26.9 
 
 		 274 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  31.34 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.46 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.77 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  25.41 
 
 		 275 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  26.79 
 
 		 272 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  23.63 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.47 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  22.09 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.54 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.2 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  27.66 
 
 		 272 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.57 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.08 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.32 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  27.48 
 
 		 273 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.74 
 
 		 171 aa  51.2  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  23.81 
 
 		 173 aa  51.2  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.04 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.42 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.61 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  21.81 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  50 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  25.77 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.37 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.67 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  27.75 
 
 		 274 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.94 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  26.34 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  27.69 
 
 		 546 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.65 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  46.51 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  25.64 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  26.32 
 
 		 458 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  27.93 
 
 		 282 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.17 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.12 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.57 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.54 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  26.32 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  33.71 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>