More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2666 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 911 aa  1737    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  37.72 
 
 		 838 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  41.69 
 
 		 871 aa  439  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  42.98 
 
 		 889 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  43.15 
 
 		 858 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  43.99 
 
 		 822 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  43.99 
 
 		 822 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  43.99 
 
 		 822 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  44.08 
 
 		 884 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  44.35 
 
 		 837 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 836 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  38.42 
 
 		 796 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  35.49 
 
 		 773 aa  257  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 801 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  30.61 
 
 		 737 aa  214  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 766 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  33.24 
 
 		 753 aa  207  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 768 aa  204  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  31.24 
 
 		 759 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  36.01 
 
 		 787 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  34.61 
 
 		 787 aa  197  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  31.04 
 
 		 881 aa  191  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 719 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.38 
 
 		 718 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 787 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 790 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 772 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 		 674 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 707 aa  184  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  30.13 
 
 		 767 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  32.46 
 
 		 717 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 701 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 717 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 715 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  37.16 
 
 		 792 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 321 aa  179  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  30.91 
 
 		 735 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  30.91 
 
 		 735 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0831  hypothetical protein  28.86 
 
 		 741 aa  170  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0229209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2835  hypothetical protein  28.68 
 
 		 741 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.49236  normal  0.59414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00775  predicted mechanosensitive channel  28.68 
 
 		 741 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2834  MscS Mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 741 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.269757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0863  hypothetical protein  28.68 
 
 		 741 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00697122  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00792  hypothetical protein  28.68 
 
 		 741 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 705 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 826 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0876  hypothetical protein  28.68 
 
 		 741 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000367014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  28.86 
 
 		 741 aa  167  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0954  hypothetical protein  28.42 
 
 		 740 aa  167  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 		 716 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  34.7 
 
 		 767 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 747 aa  165  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  37.87 
 
 		 762 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 876 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 716 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0975  hypothetical protein  28 
 
 		 740 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 879 aa  162  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  28.37 
 
 		 505 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.26 
 
 		 773 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  36.14 
 
 		 756 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0891  hypothetical protein  27.89 
 
 		 740 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0863  hypothetical protein  27.89 
 
 		 740 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0922  hypothetical protein  27.89 
 
 		 740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.493132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1295  hypothetical protein  29.62 
 
 		 737 aa  154  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 718 aa  154  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 693 aa  154  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  34.57 
 
 		 771 aa  150  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 568 aa  146  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 394 aa  146  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 658 aa  145  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 697 aa  144  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 		 757 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 356 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 755 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 273 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 784 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  34.14 
 
 		 342 aa  135  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 528 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 528 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 344 aa  134  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 288 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  27.67 
 
 		 725 aa  132  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 336 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 308 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 650 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  33.49 
 
 		 337 aa  127  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  35.5 
 
 		 304 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 350 aa  126  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  34.27 
 
 		 336 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  37.36 
 
 		 337 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  31.43 
 
 		 599 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 442 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 458 aa  121  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 327 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 325 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  31.02 
 
 		 342 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 327 aa  121  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 327 aa  121  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>