More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3512 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  68.34 
 
 		 223 aa  292  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  64.62 
 
 		 224 aa  263  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  61.17 
 
 		 224 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  52.71 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 215 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  54.04 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  47.94 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 195 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  46.11 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  40.28 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 217 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 209 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 330 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 225 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 206 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  32.84 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  48 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>