More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2115 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2103  histidine kinase  92.06 
 
 		 382 aa  707    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  100 
 
 		 379 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 1043 aa  205  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 809 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 770 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 941 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 628 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 710 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 1267 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 572 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 553 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 725 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302229  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 1807 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 670 aa  159  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  36.7 
 
 		 604 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  34.68 
 
 		 616 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 604 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 521 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  37.88 
 
 		 749 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 1028 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 828 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  34.87 
 
 		 492 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  38.69 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 575 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  37.27 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 527 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 527 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 527 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 591 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 869 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 472 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 1153 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 380 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 911 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 738 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 532 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 1252 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5844  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  39.74 
 
 		 529 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 1267 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  38.46 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 683 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 643 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  34.93 
 
 		 603 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 674 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 605 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 929 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 799 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 1166 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 526 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  38.98 
 
 		 796 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 556 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 767 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  35.22 
 
 		 1020 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  38.65 
 
 		 494 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 618 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 798 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 775 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  31.53 
 
 		 733 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 678 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 656 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 639 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 1166 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  37.65 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 859 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 483 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 478 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  38.93 
 
 		 776 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 778 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2064  histidine kinase  40.5 
 
 		 602 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 761 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  40.23 
 
 		 821 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  40.23 
 
 		 821 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 810 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  40.38 
 
 		 723 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  40.23 
 
 		 821 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  37.1 
 
 		 462 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  40.38 
 
 		 723 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  40.38 
 
 		 723 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  40.38 
 
 		 723 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 543 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 809 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 1669 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  37.04 
 
 		 812 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 714 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 1144 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>