More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2609 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  100 
 
 		 645 aa  1313    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  53.32 
 
 		 767 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  55.56 
 
 		 771 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  84.03 
 
 		 642 aa  1124    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  55.35 
 
 		 767 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  62.79 
 
 		 644 aa  866    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  45.87 
 
 		 772 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  42.86 
 
 		 841 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0411  type II secretion system protein E  45.38 
 
 		 702 aa  482  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  42.39 
 
 		 642 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  43.5 
 
 		 806 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  44.5 
 
 		 785 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  43.74 
 
 		 794 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.66 
 
 		 871 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.1 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.03 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  41.44 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.1 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  41.33 
 
 		 770 aa  412  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  40.17 
 
 		 557 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.26 
 
 		 563 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  45.32 
 
 		 684 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.9 
 
 		 568 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 568 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  47.22 
 
 		 677 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.46 
 
 		 568 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.46 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.07 
 
 		 568 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.66 
 
 		 557 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.62 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  41.71 
 
 		 738 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.1 
 
 		 553 aa  399  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  38.66 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.44 
 
 		 603 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.51 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.62 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.27 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 563 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.69 
 
 		 553 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  40.42 
 
 		 727 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.79 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.65 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.45 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.86 
 
 		 787 aa  389  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.8 
 
 		 568 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.76 
 
 		 599 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.1 
 
 		 599 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.76 
 
 		 599 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  37.52 
 
 		 578 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.82 
 
 		 561 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.52 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.03 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.24 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  37.86 
 
 		 573 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.23 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.28 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 885 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  38.63 
 
 		 572 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.25 
 
 		 553 aa  362  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.18 
 
 		 585 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.16 
 
 		 577 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  36.92 
 
 		 888 aa  361  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.92 
 
 		 572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.95 
 
 		 562 aa  357  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.33 
 
 		 559 aa  356  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.02 
 
 		 569 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  35.78 
 
 		 561 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  35.99 
 
 		 569 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.48 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.16 
 
 		 569 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 554 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  36.81 
 
 		 565 aa  355  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.81 
 
 		 569 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  38.35 
 
 		 610 aa  354  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  36.1 
 
 		 558 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 891 aa  354  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  36.28 
 
 		 567 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.6 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.42 
 
 		 570 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.24 
 
 		 570 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  45.3 
 
 		 577 aa  350  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.26 
 
 		 570 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.92 
 
 		 570 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  37.37 
 
 		 570 aa  349  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.98 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  36.85 
 
 		 577 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  35.97 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.98 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.97 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  36.74 
 
 		 577 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 564 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  37.56 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  37.01 
 
 		 574 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  38.29 
 
 		 580 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.71 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.02 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  36.58 
 
 		 589 aa  347  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  34.72 
 
 		 566 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>