285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2434 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  63.78 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  64.29 
 
 		 213 aa  254  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  60.71 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  56.63 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  62.89 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  62.16 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  48.13 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  47.69 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  43.01 
 
 		 207 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  53.01 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  45.05 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  48.97 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  46.49 
 
 		 213 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  46.83 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  46.63 
 
 		 227 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  45.15 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  47.5 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  48.13 
 
 		 247 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  47.06 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  48.4 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  42.59 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  46.12 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  44.44 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  50.83 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  39.35 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  45.5 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  45 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  45.18 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  46.82 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  46.82 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  44.62 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  46.7 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.85 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  39.35 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  46.45 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  43.15 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  46.29 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  46.63 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  46.2 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  45.21 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  45.36 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  44.92 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  41.01 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  43.92 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  43.5 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  40.39 
 
 		 492 aa  145  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  43.33 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  47.93 
 
 		 221 aa  145  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  37.24 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  43.28 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  41.45 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  49.69 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  42.42 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  42.49 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  44.21 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  40.91 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  42.5 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  45.05 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  44.5 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  36.7 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  41.63 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  47.31 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  41.38 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  37.39 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  39.7 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  36.99 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  47.97 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  38.74 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 		 239 aa  131  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  40.62 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  42.21 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  41.11 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  43.22 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 		 365 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  34.31 
 
 		 241 aa  128  6e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 365 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 365 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  39 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  41.49 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  41.24 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>