285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  69.74 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  67.83 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  58.72 
 
 		 235 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  53.78 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  53.36 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  54.04 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  51.74 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  47.93 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  47.47 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  52.02 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  52.56 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  46.73 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  49.23 
 
 		 213 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  45.34 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  50.66 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  44.32 
 
 		 186 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  40.43 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.59 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  44.07 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  42.14 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  43.26 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  44.15 
 
 		 211 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  50.99 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.36 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  47.1 
 
 		 157 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  42.2 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  33.62 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  38.05 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  35.24 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  33.97 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  34.53 
 
 		 492 aa  129  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  37.07 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  38.31 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  40.56 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  39.39 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  35.89 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  47.83 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  41.9 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  42.04 
 
 		 212 aa  125  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 		 224 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.47 
 
 		 228 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  46.72 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  37.81 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  38.75 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  36.9 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  42.38 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  37.91 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  35.18 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 217 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  37.95 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 217 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 		 217 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  36.59 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  37.24 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  34.29 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  32.4 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  31.84 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  32.4 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  35.14 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  44.37 
 
 		 222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  40.12 
 
 		 535 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  39.64 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  36.11 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  36.05 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  37.57 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 383 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  37.22 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  40.52 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  39.33 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>