286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4726 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  94.79 
 
 		 244 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  94.31 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  81.99 
 
 		 243 aa  341  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  80.19 
 
 		 236 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  83.24 
 
 		 235 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  69.27 
 
 		 225 aa  298  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 262 aa  297  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  71.5 
 
 		 262 aa  294  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  67.62 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  67.14 
 
 		 267 aa  291  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  69.86 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  68.22 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  69.19 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  64.62 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  71.83 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  64.45 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  65.28 
 
 		 237 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  66.19 
 
 		 216 aa  281  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  63.89 
 
 		 220 aa  281  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  71.9 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  66.2 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  63.94 
 
 		 246 aa  275  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  70.62 
 
 		 247 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  59.81 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  67.69 
 
 		 218 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  67.69 
 
 		 218 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  67.46 
 
 		 241 aa  266  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  63.59 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  66.84 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  66.18 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  59.24 
 
 		 216 aa  254  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  62.98 
 
 		 225 aa  248  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  65.05 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  63.46 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  59.13 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  61.43 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  52.2 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  60.2 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  57.69 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  52 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  49.01 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  56.48 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  45.54 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  39.02 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  45.3 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  44.92 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 239 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.7 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  44.69 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  38.89 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  41.11 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  41.81 
 
 		 227 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  42.42 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  37.37 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  39.04 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  40.44 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  43.82 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  43.6 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.46 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  46.5 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  43.72 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.4 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  46.5 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  41.44 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 252 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 249 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  41.57 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 246 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 249 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  41.33 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 249 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 257 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  40.25 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  41.28 
 
 		 254 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  37.23 
 
 		 238 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  36.18 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  38.25 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  43.45 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0179  lipoate-protein ligase B  43.45 
 
 		 229 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  41.85 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.7 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  37.99 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>