285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1731 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  83.91 
 
 		 241 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  70.56 
 
 		 255 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  69.49 
 
 		 255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  71.43 
 
 		 240 aa  322  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  70.21 
 
 		 245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  70.56 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  62.23 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  60.34 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  67.14 
 
 		 225 aa  287  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  61.8 
 
 		 236 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  63.95 
 
 		 262 aa  284  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  61.76 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  62.66 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  55.56 
 
 		 241 aa  276  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  59.91 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  58.62 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  60.52 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  60.67 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  65.44 
 
 		 216 aa  271  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  60.67 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  60.09 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  61.75 
 
 		 267 aa  268  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  61.75 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  60.09 
 
 		 270 aa  261  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  62.33 
 
 		 218 aa  257  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  61.4 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  61.4 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  68.33 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  68.89 
 
 		 235 aa  255  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  59.72 
 
 		 220 aa  252  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  60.19 
 
 		 216 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  62.56 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  62.56 
 
 		 226 aa  241  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  62.22 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  58.14 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  49.76 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  59.07 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  56.52 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  53.49 
 
 		 232 aa  221  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  53.33 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  53.69 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  46.95 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  46.01 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  41.78 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.4 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  39.82 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  44.9 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 365 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 365 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 205 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  42.33 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.02 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 		 227 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  41.42 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  41.83 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  44.14 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  44.14 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  38.59 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  39.67 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  39.44 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 255 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.33 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  37.84 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  39.18 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 237 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  35.26 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  40.23 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>