287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2747 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 213 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  64.76 
 
 		 214 aa  271  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  62.75 
 
 		 209 aa  269  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  58.37 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  68.97 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  60.78 
 
 		 204 aa  224  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  60.29 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  40.98 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  45.97 
 
 		 224 aa  181  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  46.77 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.72 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  46.63 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  49.46 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  46.8 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  46.46 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  41.1 
 
 		 259 aa  165  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  47.83 
 
 		 222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.77 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 230 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  41.36 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  40.18 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  42.63 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 		 383 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  43.13 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 227 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  38.43 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  37.61 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  44.08 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  43.89 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  37.95 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  47.67 
 
 		 365 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  47.67 
 
 		 365 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  41.06 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  43.72 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  47.31 
 
 		 365 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  48.31 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  44.02 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  45.35 
 
 		 239 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  51.35 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  45.31 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  43.3 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  45.35 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  45.77 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  43.68 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  41.78 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 492 aa  147  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  46.46 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  49.01 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  46.04 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  45.14 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  42.27 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  44.06 
 
 		 535 aa  146  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  39.81 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  39.62 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  48.39 
 
 		 277 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 240 aa  144  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  43.5 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  43.24 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  41 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  43.22 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  40.69 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  42.51 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  42.51 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  42.51 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  44.09 
 
 		 262 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  45.26 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  44.2 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  41 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  40.5 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  41.83 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  40.59 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  39.7 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  41.97 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  37 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  40.21 
 
 		 239 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  41.42 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  41.38 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  44 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  40.21 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 267 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  43.46 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>