285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1775 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 277 aa  544  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  60.95 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  63.29 
 
 		 213 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  61.58 
 
 		 213 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  60.49 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  58.74 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  58.15 
 
 		 247 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  58.45 
 
 		 213 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  60.47 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  60.47 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  60.47 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  64.43 
 
 		 230 aa  232  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  56.89 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  57.92 
 
 		 238 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  58.17 
 
 		 225 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  63.49 
 
 		 221 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  57.35 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  61.42 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  55.81 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  57.77 
 
 		 234 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  61.58 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  55.96 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  57.89 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  48.79 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  54.33 
 
 		 227 aa  208  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  56.25 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  56.93 
 
 		 218 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  51.88 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  54.04 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  53.74 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  53.33 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  52.2 
 
 		 221 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  50.51 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  48.66 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  46.38 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  50.23 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  46.09 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  48.17 
 
 		 222 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  45.37 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  42.21 
 
 		 207 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  48.08 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  48.42 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  53.49 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  39.83 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.84 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  43.4 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  37.67 
 
 		 240 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  44.21 
 
 		 214 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  48.39 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  44.5 
 
 		 240 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  47.46 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  38.91 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  46.2 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  37.39 
 
 		 244 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  36.82 
 
 		 231 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  45.79 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  45.41 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  36.21 
 
 		 231 aa  139  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  43.16 
 
 		 212 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.94 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  43.23 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  46.33 
 
 		 227 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  43.23 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  42.27 
 
 		 365 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.27 
 
 		 365 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  41.47 
 
 		 365 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  35.37 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  42 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  39.73 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  40.29 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  45.14 
 
 		 202 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  41.24 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  46.33 
 
 		 222 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  37.26 
 
 		 228 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  41.2 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  41.8 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.63 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.06 
 
 		 492 aa  125  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  40.47 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  38.62 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  40.53 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  45.16 
 
 		 535 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  40.67 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  45.5 
 
 		 204 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  44.68 
 
 		 204 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  47.27 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  44.09 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  38.28 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  40.32 
 
 		 218 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  39.04 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  39.25 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  40.59 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  39.15 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>