285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0609 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  52.21 
 
 		 228 aa  244  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  50.49 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  43.93 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  43.87 
 
 		 492 aa  176  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  43.33 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  44.15 
 
 		 383 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  45.99 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  46.2 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  46.2 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  39.73 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  42.49 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  40.27 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  40.81 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  42.73 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  42.92 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.95 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  42.34 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40.47 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  39.38 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  38.36 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  36.64 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  39.91 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  38.73 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.09 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  39.91 
 
 		 535 aa  143  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  39.13 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  34.98 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  40.3 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  37.74 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  37.74 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  37.75 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  37.74 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  35.53 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  36.45 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  35.82 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  38.14 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  36.45 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  31.3 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  34.11 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  38.38 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  34.11 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  32.88 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  38.62 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  37.13 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  34.11 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  36.79 
 
 		 238 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  36.53 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  34.11 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  34.95 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  34.85 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  35.71 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  33.82 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  39.04 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  34.29 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  36.61 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  38.62 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  35.07 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  36.76 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  32.24 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  34.72 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  34.56 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  33.02 
 
 		 262 aa  124  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  35.44 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  33.83 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  36.5 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  33.82 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  40.25 
 
 		 157 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  36.08 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  34.58 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  35.33 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  38.62 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  35.75 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  34.87 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  32.6 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>