285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1770 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  66.06 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  46.93 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.79 
 
 		 207 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  42.73 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  44.95 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.46 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  39.06 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  39.83 
 
 		 238 aa  165  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.29 
 
 		 492 aa  166  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  42.48 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  39.06 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  41.33 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  40.81 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.63 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  39.36 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  41.26 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  42.33 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  37.83 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  40.44 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  41.1 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  37.76 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  35.78 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  43.52 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.95 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  40.65 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  40.65 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  38.71 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  35.74 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  41.84 
 
 		 277 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  40.4 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  36.05 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  37.78 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  38.12 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  35.09 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  38.79 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  35.09 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  39.23 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  38.34 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  34.16 
 
 		 268 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  38.94 
 
 		 535 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  38.22 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  38.91 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  38.91 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  38.07 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 251 aa  131  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  36.82 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  38.84 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  38.07 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  37.72 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  40.84 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  37.75 
 
 		 365 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.22 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  38.78 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  38.57 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 383 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  35.89 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  36.7 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  35.42 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  37.82 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  31.6 
 
 		 233 aa  121  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  37.21 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  36.49 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  36.79 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  34.25 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  36.62 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  36.28 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  34.87 
 
 		 221 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  39.11 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  37.17 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  39.06 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  30.84 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  36.6 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  33.63 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>