285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1515 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  63.68 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  66.07 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  64.71 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  64.71 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  64.71 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  64.13 
 
 		 238 aa  279  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  61.82 
 
 		 238 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  65.05 
 
 		 213 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  58.6 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  61.03 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  64.95 
 
 		 213 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  62.73 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  64.43 
 
 		 213 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  60 
 
 		 213 aa  245  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  59.31 
 
 		 221 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  55.02 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  63.21 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  58.64 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  58.55 
 
 		 227 aa  224  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  59.89 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  56.19 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  51.77 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  56.74 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  54.42 
 
 		 246 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  56.22 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  58.06 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  56.12 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  56.78 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  52.31 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  51.76 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  54.12 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  51.46 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  44.66 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  41.23 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35.19 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  36.8 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  36.75 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  35.9 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  36.21 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  46.93 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41.78 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  40.69 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.28 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  38.89 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  40.33 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  36.04 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  41.06 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  38.64 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  40.69 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  38.99 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.07 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  43 
 
 		 535 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  37.69 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  37.22 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  38.35 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  37.83 
 
 		 383 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  35.62 
 
 		 492 aa  134  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37.56 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  35.04 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  40 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  38.78 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  39.68 
 
 		 365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  39.68 
 
 		 365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  38.95 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  35.48 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  42.08 
 
 		 217 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  39.17 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 		 204 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  34.62 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.29 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  38.17 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  36.46 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  39.44 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>