286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4211 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 244 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  98.36 
 
 		 244 aa  483  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  94.79 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  75.73 
 
 		 236 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  76.47 
 
 		 243 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  67.84 
 
 		 267 aa  313  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  69.37 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  67.4 
 
 		 267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  77.29 
 
 		 235 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  71.96 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  66.53 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  66.96 
 
 		 255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  64.6 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  68.7 
 
 		 245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  68.12 
 
 		 225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  64.2 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  65.18 
 
 		 270 aa  298  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  63.48 
 
 		 237 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  65.38 
 
 		 244 aa  295  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  63.23 
 
 		 246 aa  295  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  63.76 
 
 		 237 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  66.26 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  63.76 
 
 		 220 aa  288  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  59.65 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  67.37 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  62.6 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  64.02 
 
 		 216 aa  278  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  63.38 
 
 		 218 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  63.38 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  63.38 
 
 		 218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  65.28 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  60.67 
 
 		 231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  60.56 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  64.32 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  61.97 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  60.63 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  58.96 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  62.04 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  51.69 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  59.09 
 
 		 217 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  50.72 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  49.76 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  57.07 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.55 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  45.86 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  41.76 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  39.52 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  43.06 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  41.44 
 
 		 213 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  44.69 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  39.39 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 218 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  41.21 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 227 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.38 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  37.88 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  40.28 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  42.37 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.74 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  39.78 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  40.66 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  45.81 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  37.1 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  43.26 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  40.41 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 365 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 365 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  42.47 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  37.74 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  33.82 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  40.43 
 
 		 247 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.04 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  41.3 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  42.25 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 383 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  35.32 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  35.15 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  43.46 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  40.12 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>