286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0350 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  60.68 
 
 		 209 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  59.02 
 
 		 214 aa  254  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  58.37 
 
 		 213 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  66.86 
 
 		 227 aa  246  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  53.43 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  52.45 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  45.78 
 
 		 231 aa  184  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  44.49 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  51.05 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  45.59 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  42.67 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  43.3 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  45.81 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  47.03 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  48.22 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  42.6 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  44.93 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  41.52 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  44.28 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  44.28 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  42.2 
 
 		 259 aa  161  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  49.14 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  42.33 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  45.1 
 
 		 277 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 245 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  46.49 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  47.12 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  47.42 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  44.93 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  43.54 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  44.34 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  42.03 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  40.09 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 262 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  40.18 
 
 		 246 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  43.52 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  47.19 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 		 239 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  47.03 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  41.78 
 
 		 240 aa  147  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  39.64 
 
 		 251 aa  147  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  40.85 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  37.07 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  41.79 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  41.58 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  41.79 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  41.43 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 267 aa  141  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  40.67 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  42.72 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  40.38 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  40.29 
 
 		 492 aa  139  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  38.53 
 
 		 247 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  39.61 
 
 		 270 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  45.22 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  40.32 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  41.94 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  40.32 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  37.2 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  39.61 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  39.61 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>