285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3579 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  80.91 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  81.01 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  78.39 
 
 		 240 aa  346  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  76.82 
 
 		 247 aa  340  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  74.79 
 
 		 241 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  70.94 
 
 		 239 aa  332  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  70.21 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  66.25 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  68.3 
 
 		 236 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  68.7 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  64.85 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  65.57 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  70.28 
 
 		 225 aa  308  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  71.23 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  67.89 
 
 		 244 aa  305  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  65.29 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  70.78 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  65.4 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  66.38 
 
 		 237 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  65.11 
 
 		 237 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  66.52 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  67.71 
 
 		 270 aa  294  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  68.06 
 
 		 216 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  61.36 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  71.83 
 
 		 211 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  64.81 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  70.89 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  65.28 
 
 		 218 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  65.28 
 
 		 218 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  64.19 
 
 		 218 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  64.29 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  61.14 
 
 		 216 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  67.14 
 
 		 218 aa  251  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  65.14 
 
 		 226 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  61.16 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  57.14 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  59.26 
 
 		 228 aa  231  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  51.67 
 
 		 205 aa  231  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  56.16 
 
 		 217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  53.92 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  48.34 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  49.76 
 
 		 214 aa  216  4e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  50.91 
 
 		 222 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  45.37 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.41 
 
 		 365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.41 
 
 		 365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  44.86 
 
 		 365 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  45.41 
 
 		 383 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.8 
 
 		 211 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.54 
 
 		 228 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  45.5 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  39.7 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 214 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  42.62 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  37.81 
 
 		 213 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 233 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  45.71 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  42.39 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  41.81 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  40.31 
 
 		 205 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  39.57 
 
 		 221 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  41.57 
 
 		 255 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  40.31 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 		 207 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.48 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  43.96 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  38.03 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  39.56 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  35.9 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  36.87 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  39.01 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  41.48 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  41.45 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  39.55 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  41.8 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  41.44 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  45.39 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  42.07 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  43.65 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  45.39 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  45.39 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  45.39 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  45.39 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  44.51 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>