284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2163 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  83.91 
 
 		 231 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  74.78 
 
 		 255 aa  340  8e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  74.48 
 
 		 240 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  73.8 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  74.79 
 
 		 245 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  75.97 
 
 		 247 aa  331  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  66.1 
 
 		 239 aa  319  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  63.79 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  67.25 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  69.48 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  63.07 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  63.56 
 
 		 236 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  66.52 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  66.52 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  64.26 
 
 		 262 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  68.2 
 
 		 216 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  62.98 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  61.54 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  63.01 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  62.82 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  62.6 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  61.09 
 
 		 270 aa  281  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  56.78 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  61.97 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  63.13 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  63.72 
 
 		 218 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  62.91 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  62.33 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  62.33 
 
 		 218 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  68.51 
 
 		 211 aa  258  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  69.4 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  62.98 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  62.67 
 
 		 218 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  65.57 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  60.93 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  60.19 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  61.11 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  48.82 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  56.07 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  47.42 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  48.83 
 
 		 214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 		 217 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  54.68 
 
 		 222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  44.6 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 365 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 365 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 365 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 383 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  42.08 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  42.08 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.94 
 
 		 207 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.45 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  42.64 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  44.75 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  40.1 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  42.31 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  44.58 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  42.41 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.12 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  40.32 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  41.76 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  37.31 
 
 		 229 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  41.9 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  41.24 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  38.46 
 
 		 199 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  38.97 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  43.68 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  43.23 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  45 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  43.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  41.9 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  42.64 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  40.88 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  46.81 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  46.81 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  46.1 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  42.42 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  46.81 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>