285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1621 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  69.96 
 
 		 244 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  69.96 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  69.96 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  71.43 
 
 		 255 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  70.35 
 
 		 255 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  67.09 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  65.68 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  70.94 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  68 
 
 		 246 aa  310  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  70.97 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  62.55 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  65.25 
 
 		 262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  70 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  66.09 
 
 		 225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  63.98 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  66.1 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  64.32 
 
 		 243 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  63.56 
 
 		 237 aa  297  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  66.38 
 
 		 236 aa  295  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  66.2 
 
 		 220 aa  295  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  67.37 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  66.24 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  66.53 
 
 		 244 aa  291  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  63.59 
 
 		 218 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  63.59 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  60.34 
 
 		 231 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  64.35 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  69.01 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  67.27 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  63.13 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  69.55 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  70.97 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  63.43 
 
 		 216 aa  267  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  60.63 
 
 		 225 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  59.91 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  58.02 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  61.57 
 
 		 226 aa  234  9e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  50.93 
 
 		 205 aa  232  4.0000000000000004e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  56.19 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 214 aa  228  9e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  54.09 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  56.28 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  48.61 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  44.75 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  44.34 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.63 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 226 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  43.69 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  42.5 
 
 		 365 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.5 
 
 		 365 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  42 
 
 		 365 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  39.18 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  39.52 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  42.63 
 
 		 383 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  44.74 
 
 		 203 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  42.56 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.64 
 
 		 231 aa  132  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.79 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 241 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  42.44 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  37.73 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  43.85 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  39.25 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  37.82 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  37.82 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  41.86 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  41.57 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  40.39 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  41.86 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  38.17 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  41.86 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  37.31 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  39.43 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  38.17 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  40.7 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  37.61 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>