285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0589 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  99.25 
 
 		 267 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  84.07 
 
 		 270 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  76.44 
 
 		 246 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  70.46 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  65.68 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  75.81 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  71 
 
 		 237 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  71.3 
 
 		 243 aa  328  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  69.96 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  70.7 
 
 		 220 aa  322  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  65.43 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  63.6 
 
 		 243 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  69.12 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 218 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  62.4 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 218 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 218 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  69.74 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  67.09 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  68.54 
 
 		 225 aa  301  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  68.28 
 
 		 244 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  72.43 
 
 		 218 aa  298  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  67.84 
 
 		 244 aa  298  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  68.69 
 
 		 216 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  66.39 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  70.45 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  67.61 
 
 		 225 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  62.56 
 
 		 216 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  69.91 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  70.09 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  65.3 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  67.62 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  66.52 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  66.21 
 
 		 226 aa  264  8.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  61.93 
 
 		 228 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  61.75 
 
 		 231 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  57.28 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  51.64 
 
 		 205 aa  241  7e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  53.42 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  49.53 
 
 		 214 aa  236  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  50.93 
 
 		 214 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  52.09 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  59.79 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  46.79 
 
 		 209 aa  209  4e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  46.52 
 
 		 203 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  45.56 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  45.56 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 218 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.95 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  40.21 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  40.4 
 
 		 215 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 215 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  39.13 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  42.35 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.62 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  37.68 
 
 		 216 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  41.41 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  42.03 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 		 220 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 216 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 218 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 205 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 215 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  39.05 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  43.93 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  43.35 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  43.35 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  41.21 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  36.08 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 365 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 217 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 217 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  37.73 
 
 		 238 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  34.95 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>