284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1026 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 262 aa  530  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  79.83 
 
 		 237 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  80.17 
 
 		 237 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  72.8 
 
 		 243 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  70.46 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  70.46 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  71.82 
 
 		 270 aa  328  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  70.35 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  69.47 
 
 		 243 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  60.78 
 
 		 241 aa  311  7.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  68.72 
 
 		 236 aa  311  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  65.25 
 
 		 239 aa  305  6e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  64.49 
 
 		 244 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  69.37 
 
 		 244 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  70.09 
 
 		 216 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  67.89 
 
 		 225 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  62.98 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 220 aa  293  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  65.57 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  64.78 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  66.2 
 
 		 218 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  66.2 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  70.28 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  65.53 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  75 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  64.29 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  67.86 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  68.08 
 
 		 218 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  64.26 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  66.98 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  62.66 
 
 		 231 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  63.85 
 
 		 225 aa  264  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  58.18 
 
 		 216 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  55.91 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  60.18 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  49.07 
 
 		 214 aa  228  9e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  48.58 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  55.5 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  48.6 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  51.08 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  53.33 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  43.52 
 
 		 209 aa  205  7e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  57.14 
 
 		 222 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  46.49 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  43.15 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.57 
 
 		 212 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  42.13 
 
 		 218 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  44.57 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  40.18 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  41.54 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  40.55 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  40.89 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  47.88 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  41.54 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  40.4 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  41.23 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  37.39 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  41.54 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  42.36 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  41.08 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  41.08 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  41.54 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 		 227 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  40.53 
 
 		 222 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  39.47 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  43.62 
 
 		 214 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  43.6 
 
 		 220 aa  138  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  40.21 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 212 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.72 
 
 		 228 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  44.16 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  44.16 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  44.16 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  37.8 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 214 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  37.96 
 
 		 217 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  37.96 
 
 		 217 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>