285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0528 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  43.92 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  42.86 
 
 		 199 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  45.21 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  43.12 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  43.07 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.24 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  42.57 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 270 aa  144  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  46.67 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 		 262 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  41.63 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  44.06 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  42.63 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  41.09 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  48.24 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2500  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  37.81 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  41.45 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  38.24 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  39.6 
 
 		 236 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  43.75 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 241 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37.5 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  34.91 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  41.18 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  36.79 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  40.67 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  41.5 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  44.25 
 
 		 247 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  43.09 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  39.11 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 236 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  46.02 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  40.72 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  40.83 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  44.57 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  45.29 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  46.99 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 		 218 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  44.38 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  41.9 
 
 		 244 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  42.54 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  45.68 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  36.95 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  38.17 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  39.15 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  39.15 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  36.45 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  34.16 
 
 		 241 aa  131  6.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  42.7 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  44.19 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  38.68 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  43.18 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  39.64 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  39.64 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  38.42 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  47.95 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  39.64 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  39.64 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  42.61 
 
 		 255 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  41.95 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  42.07 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  39.11 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  41.24 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>