285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3805 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  74.9 
 
 		 236 aa  345  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  76.47 
 
 		 244 aa  337  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  76.05 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  70.89 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  63.6 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  63.2 
 
 		 267 aa  315  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  81.99 
 
 		 211 aa  314  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  69.47 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  81.77 
 
 		 235 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  70.53 
 
 		 225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  65.32 
 
 		 270 aa  301  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  67.89 
 
 		 220 aa  301  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  66.06 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  64.32 
 
 		 239 aa  298  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  66.67 
 
 		 246 aa  296  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  65.25 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  67.42 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  66.12 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  68.54 
 
 		 218 aa  294  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  69.3 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  71.56 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  60.83 
 
 		 241 aa  291  9e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  69.48 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  66.82 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  65.29 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  70.33 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  70.78 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  62.44 
 
 		 216 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  63.07 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  61.76 
 
 		 231 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  64.98 
 
 		 225 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  63.51 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  59.62 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  49.76 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  59.8 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  62.56 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  59.07 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  48.82 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  48.79 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  60.1 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  56.1 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  38.64 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  46.29 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  43.59 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  44.92 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  46.86 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  38.76 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  43.43 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  39.32 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  38.12 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  40.98 
 
 		 231 aa  138  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  45.66 
 
 		 203 aa  138  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  38.83 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.94 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  39.42 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  45.14 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  43.53 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.95 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  41.82 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  46.91 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.95 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  45.61 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  46.19 
 
 		 213 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  39.66 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  38.33 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  41.55 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  45.18 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  41.14 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  46.7 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  40.54 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.38 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.77 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  39.05 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  37.99 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  36.65 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  37.02 
 
 		 202 aa  131  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  47.92 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  37.84 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  37.43 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>