285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0698 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  69.96 
 
 		 239 aa  344  8.999999999999999e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  69.27 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  67.57 
 
 		 243 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  62.4 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  62 
 
 		 267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  57.98 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  64.91 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  68.75 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  68.3 
 
 		 255 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  65.25 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  68.52 
 
 		 220 aa  295  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  68.2 
 
 		 216 aa  295  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  67.91 
 
 		 218 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  62.98 
 
 		 262 aa  293  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  65.94 
 
 		 225 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  66.25 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  66.95 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  63.56 
 
 		 262 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  67.44 
 
 		 218 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  67.44 
 
 		 218 aa  291  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  62.23 
 
 		 231 aa  289  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  66.82 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  65.81 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  64.89 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  63.79 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  65.9 
 
 		 237 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  65.38 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  64.38 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  68.08 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  67.58 
 
 		 235 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  66.51 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  62.45 
 
 		 241 aa  261  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  69.19 
 
 		 211 aa  257  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  59.17 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  59.26 
 
 		 216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  61.93 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  59.82 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  59.62 
 
 		 217 aa  234  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  47.2 
 
 		 205 aa  229  4e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  54.71 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  48.15 
 
 		 214 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  54.67 
 
 		 222 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  44.5 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  40.83 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 211 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 		 365 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 		 365 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 		 365 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.45 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.88 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 383 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  40.87 
 
 		 215 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  36.06 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  36.44 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  42.51 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  40.54 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  39.17 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  40.2 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  40.87 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  40.87 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  34.94 
 
 		 216 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  37.32 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40.62 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  41.84 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  37.32 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  43 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  39.52 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  44.69 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  37.28 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 213 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.71 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  39.36 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  42.24 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  42.18 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  38.39 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  39.43 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  41.86 
 
 		 227 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  34.93 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>