285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1031 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  65.2 
 
 		 214 aa  278  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  62.75 
 
 		 213 aa  269  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  60.68 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  56.63 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  54.41 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  53.43 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  43.56 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.87 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  46.39 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  44.33 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  43.63 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.27 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  43.28 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  39.29 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  44.55 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  40.57 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  158  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  37.98 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  41.43 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.77 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  47.43 
 
 		 227 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  40.27 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  40.1 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.54 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  42.79 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  36.28 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  43.2 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  43.65 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  43.54 
 
 		 251 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  47.51 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  37.72 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 492 aa  149  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  41.45 
 
 		 239 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 259 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  41.45 
 
 		 239 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  43.63 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  46.24 
 
 		 277 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  46.02 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  47.02 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  41.78 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 		 238 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  42.71 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  45.15 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  44.66 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  39.47 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  38.31 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  42.07 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  36.07 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  39.5 
 
 		 247 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  40.98 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  39.39 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  39.52 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 365 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  38.19 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  41.3 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  39.8 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  38.19 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  37.69 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  39 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  45.35 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  37.11 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  45.35 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  40.3 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  43.01 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  38.94 
 
 		 383 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  36.06 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  41.57 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  46.67 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 		 232 aa  134  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  35.86 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  36.98 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  35.6 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  41.57 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  38.94 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  38.94 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  36.6 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  38.94 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  37.22 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  38.27 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  39.36 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  38.17 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  39.36 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>